Guanajuato alberga una selecta oferta de hoteles de lujo, muchos de ellos en el centro histórico. Edelmira Hotel Boutique cuenta con piscina interior y jacuzzi en la azotea, mientras que 1850 Hotel Boutique ofrece spa y un sky bar con vistas a la ciudad. Casa del Rector Hotel Boutique (solo adultos) dispone de piscina al aire libre y jardín, y Hotel Boutique Corazón Mexicano & Spa combina tratamientos de spa con estacionamiento gratuito. Nueve 25 Hotel Boutique completa la oferta con terraza y restaurante.
Estos hoteles boutique y de lujo se concentran en el centro, a pocos pasos del Jardín Unión y el Teatro Juárez. Las tarifas varían según temporada, pero en general superan los $100 por noche. Para asegurar disponibilidad en fines de semana y festivales, conviene reservar con semanas de antelación. Todos ofrecen wifi gratuito, aire acondicionado y servicio a la habitación.