Los hoteles 3 estrellas en Guanajuato se concentran en el centro histórico, a pocos pasos de la Basílica de Nuestra Señora de Guanajuato y el Jardín de la Unión. Suelen incluir desayuno y WiFi gratuito en la tarifa, con precios accesibles para viajeros que priorizan la ubicación sobre servicios extra. Algunos disponen de parking privado o piscina, aunque no es lo común. Para moverse por las calles empedradas y los callejones, lo mejor es alojarse en el centro y dejar el coche en el hotel.
Entre los mejor valorados destacan el Hotel Santa Regina (89), con desayuno incluido en un hotel vecino y habitaciones amplias frente al Jardín Unión; el Hotel de la Paz (90), con terraza con vistas a la ciudad y desayuno americano gratis en la Plaza de la Paz; y el Hotel Indigo Guanajuato by IHG (95), que ofrece café en la habitación y está a 500 metros del Museo de las Momias. Para familias, el Hotel Camino de Piedra cuenta con piscina al aire libre y parque infantil, mientras que el Hotel Spa Maggic Home Panorámica combina spa, piscina cubierta y parking gratuito. El Hotel 1988 Guanajuato (79) también ofrece piscina, parking y vistas panorámicas desde su terraza.