Los hoteles boutique en el centro de Oaxaca se ubican en edificios históricos restaurados, a poca distancia de la Catedral y el Zócalo. Ofrecen alojamiento con piscinas al aire libre, restaurantes de cocina local y WiFi gratuito. Las tarifas abarcan desde opciones económicas hasta establecimientos de lujo, y se recomienda reservar con antelación, especialmente en temporada alta.
Entre los más destacados se encuentran el Hotel Casantica, un antiguo convento del siglo XVI con cascada en la piscina, y el Hotel Abu, reconocido por su enfoque ecológico. El Hotel Azul de Oaxaca cuenta con un bar en la azotea con vistas panorámicas, mientras que el Quinta Real Oaxaca ofrece estilo colonial junto a la iglesia de Santo Domingo. Para una experiencia más tranquila, el Los Pilares Hotel, en el barrio de Jalatlaco, dispone de piscina y aparcamiento gratuito.