Los moteles en San Francisco ofrecen una alternativa práctica y económica frente a los hoteles del centro. Este tipo de alojamiento se concentra en barrios como Marina, Nob Hill y Van Ness, todos con acceso directo a las líneas de cable car y a poca distancia de atracciones como el Puente Golden Gate y Fisherman's Wharf. La mayoría incluye estacionamiento gratuito en el lugar, un beneficio poco común en una ciudad donde el estacionamiento diario puede superar los $40.
Las tarifas nocturnas oscilan entre $80 y $150, dependiendo de la temporada y la ubicación. El Motel Capri, con puntuación de 8.2, destaca por su desayuno ligero tipo 'grab and go' y habitaciones completamente libres de humo. El Geary Parkway Motel, también con 8.2, ofrece habitaciones en planta baja y se encuentra a 2.3 km de Baker Beach. Todos los moteles listados incluyen WiFi gratuito, refrigerador y microondas en cada habitación. Se recomienda reservar con anticipación entre mayo y octubre, cuando la ocupación alcanza su punto máximo.