Puerto Vallarta alberga varias haciendas históricas que combinan arquitectura colonial con comodidades modernas. Estas propiedades, ubicadas en zonas como Marina Vallarta y el centro de la ciudad, ofrecen desde habitaciones boutique hasta resorts todo incluido frente al mar. Los viajeros pueden esperar piscinas al aire libre, restaurantes con cocina local y acceso directo a la playa. Los presupuestos varían, con opciones accesibles a partir de $100 USD por noche en hoteles pequeños, hasta tarifas más altas en resorts de lujo. Es recomendable reservar con anticipación durante temporada alta (diciembre a abril).
Entre los alojamientos mejor calificados se encuentra el Krystal Vallarta, un resort con tres piscinas y tres restaurantes, ideal para familias gracias a su playa privada y ubicación a 1.6 km del centro. El Melia Puerto Vallarta, en Marina Vallarta, destaca por su régimen todo incluido, club infantil, tirolesa y campo de golf cercano; recibió una calificación de 85/100. Para quienes buscan una experiencia más íntima, el Garlands Del Rio Riverside Boutique Hotel, en pleno centro, ofrece un ambiente estilo bed and breakfast con spa, yoga, bañera de hidromasaje y desayuno casero; su puntuación de 90/100 lo convierte en el mejor valorado de la categoría.