Isla Mujeres ofrece opciones de alojamiento económico sin sacrificar ubicación ni servicios básicos. En el centro, cerca del muelle y de playas como Norte Beach y Playa El Cocal, se concentran hoteles con tarifas desde $50 USD por noche. Estos establecimientos suelen incluir piscina al aire libre, WiFi gratuito y aire acondicionado. Para moverse por la isla, de solo 7 km de largo, lo ideal es rentar un carrito de golf o bicicleta. La mayoría de los hoteles baratos se ubican a pocas cuadras de los restaurantes y tiendas del centro, lo que permite explorar a pie.
Entre los mejor valorados están el Hotel Posada del Mar, con área de playa privada y restaurante frente al mar; y Rocamar Hotel Isla Mujeres, con habitaciones con vista al Caribe y piscina. Para una experiencia más íntima, Hotel Caracol cuenta con solo 12 habitaciones y un jardín interior. Nilu Isla Mujeres by Selina ofrece ambiente juvenil con yoga y música en vivo, mientras que Hotel Casa Caracol está a 200 metros de Norte Beach y dispone de cocina en algunas habitaciones. Todos combinan precio accesible con acceso rápido a las principales atracciones de la isla.