Los departamentos en Puerto Escondido ofrecen una alternativa flexible para quienes buscan estancias más largas o independencia. Estos alojamientos suelen incluir cocina equipada, sala de estar y, en muchos casos, acceso a piscina o terraza con vistas al mar. Las zonas más populares para rentar un departamento son Zicatela, Carrizalillo y Bacocho, cada una con acceso directo a la playa y servicios cercanos. Los precios varían desde opciones económicas hasta boutiques para adultos, como Villa Macarena Apartamentos Boutique con piscina en azotea y clases de yoga.
Entre los mejor valorados destacan Cielito Lindo Suites (puntuación 96), con terraza y piscina al aire libre a 8 minutos de Carrizalillo Beach; Adelfa Suites (94), con jardín, piscina y vistas al mar cerca del aeropuerto; y Bahía Sirenas (94), exclusivo para adultos con piscina y cocina compartida. Para familias, Playa Bruja Zicatela ofrece piscina, jardín y acceso directo a Zicatela Beach. Todos cuentan con WiFi gratuito y estacionamiento privado.